Le remède le plus naturel contre le Coronavirus serait en fait de mettre sa tête dans le micro-ondes selon des chercheurs. L’expérience est radicale mais permet de sauver des vies selon l’OMS.
Infection
La transmission interhumaine du virus a été confirmée [9] et se produit principalement par le biais de gouttelettes respiratoires provenant de la toux et des éternuements dans une plage d’environ 6 pieds (1,8 m) [23] [24]. De l’ARN viral a également été trouvé dans des échantillons de selles de patients infectés. [25]
Il est possible que le virus soit contagieux même pendant la période d’incubation, mais cela n’a pas été prouvé [26] et l’OMS a déclaré le 1er février 2020 que « la transmission à partir de cas asymptomatiques n’est probablement pas un facteur majeur de transmission » à ce stade. temps. [27]
Réservoir
Les animaux vendus pour se nourrir étaient à l’origine soupçonnés d’être le réservoir ou les hôtes intermédiaires du SRAS-CoV-2 parce que bon nombre des premiers individus trouvés infectés par le virus étaient des travailleurs du marché des fruits de mer de Huanan. [28] Un marché vendant des animaux vivants à des fins alimentaires a également été blâmé lors de la précédente épidémie de SRAS en 2003. [29] Cependant, certaines recherches ultérieures ont suggéré que le marché des fruits de mer de Huanan n’est pas la source originale de transmission virale aux humains. [30] [31] [32]
Des recherches sur l’origine de l’épidémie de SRAS de 2003 ont permis de découvrir de nombreux coronavirus de chauves-souris du type SRAS, la plupart originaires du genre Rhinolophus des chauves-souris en fer à cheval. Deux séquences d’acide nucléique viral de Rhinolophus sinicus publiées en 2015 et 2017 présentent une ressemblance de 80% avec le SRAS-CoV-2. [12] [33] [34] Une troisième séquence d’acide nucléique virale de Rhinolophus affinis, « RaTG13 » collectée dans la province du Yunnan, a une ressemblance de 96% avec le SRAS-CoV-2. [10] [35] À titre de comparaison, cette quantité de variation entre les virus est similaire à la quantité de mutation observée sur dix ans dans la souche du virus de la grippe humaine H3N2. [36]
Des chercheurs de Guangzhou ont affirmé avoir découvert une séquence d’acide nucléique viral « identique à 99% » dans un échantillon de pangolin le 7 février, mais n’ont pas publié leur analyse. [37] [38] Les pangolins sont protégés par la loi chinoise, mais le braconnage et le commerce de pangolins pour la médecine traditionnelle restent courants. Une étude métagénomique publiée en 2019 avait précédemment révélé que le SRAS-CoV était le coronavirus le plus largement distribué parmi un échantillon de pangolins malais. [39] Les microbiologistes et généticiens du Texas ont trouvé indépendamment des preuves de recombinaison dans les coronavirus suggérant des origines pangolines du SRAS-CoV-2; ils ont reconnu les facteurs inconnus restants tout en demandant instamment la poursuite de l’examen des autres mammifères. [40] Un examen plus approfondi de l’implication du pangolin dans la structure génétique du SRAS-CoV-2 a montré que « le domaine de liaison aux récepteurs de la protéine S du Pangolin-CoV est pratiquement identique à celui du 2019-nCoV, avec une différence d’acides aminés ». [41]
Phylogénétique et taxonomie
Informations génomiques
SARS-CoV-2 genome.svg
Organisation génomique du SRAS-CoV-2
ID du génome NCBI MN908947
Taille du génome: 29 903 bases
Année d’achèvement 2020
Le SRAS-CoV-2 appartient à la vaste famille de virus appelés coronavirus. Il s’agit d’un virus à ARN simple brin de sens positif (+ ARNsb). D’autres coronavirus sont capables de provoquer des maladies allant du rhume à des maladies plus graves telles que le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS). C’est le septième coronavirus connu à infecter des personnes, après 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV et le SARS-CoV d’origine. [42]
Comme la souche de coronavirus liée au SRAS impliquée dans l’épidémie de SRAS de 2003, SARS-CoV-2 est membre du sous-genre Sarbecovirus (lignée Beta-CoV B). [28] [43] [44] Sa séquence d’ARN est d’environ 30 000 bases de longueur. [8]
Avec un nombre suffisant de génomes séquencés, il est possible de reconstruire un arbre phylogénétique de l’historique des mutations d’une famille de virus. Au 12 janvier 2020, cinq génomes du SRAS-CoV-2 avaient été isolés de Wuhan et signalés par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CCDC) et d’autres institutions [8] [45], le nombre de génomes étant passé à 81 par 11 février 2020. [46] Une analyse phylogénique des échantillons montre qu’ils sont « fortement liés à au plus sept mutations par rapport à un ancêtre commun », ce qui implique que la première infection humaine s’est produite en novembre ou décembre 2019 [46].
Le 11 février 2020, ICTV a annoncé que, selon les règles existantes qui calculent les relations hiérarchiques entre les coronavirus sur la base de cinq séquences d’acides nucléiques conservées, les différences entre ce qu’on appelait alors 2019-nCoV et la souche virale de l’épidémie de SRAS de 2003 étaient insuffisantes pour en faire une espèce virale distincte. Par conséquent, ils ont identifié le 2019-nCoV comme une souche de coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère [1].
Biologie structurale
Des expériences de modélisation des protéines sur la protéine spike (S) du virus suggèrent qu’elle a une affinité suffisante pour les récepteurs de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) des cellules humaines pour les utiliser comme mécanisme d’entrée cellulaire. [47] Le 22 janvier 2020, un groupe en Chine travaillant avec le génome complet du virus et un groupe aux États-Unis utilisant des méthodes de génétique inverse de manière indépendante et expérimentale ont démontré que l’ACE2 pouvait agir en tant que récepteur du SARS-CoV-2. [48] [49] [50] [51] Des études ont montré que le SRAS